Üniversite 3. sınıfta Turkcell’e web danışmanlığı hizmeti vererek profesyonel kariyer hayatına başladı. 2 Sene süren bu tecrübenin ardından 2012 yılında eBay Turkey|GittiGidiyor’da dijital pazarlama departmanına katıldı. GittiGidiyor’da çalıştığı süre içerisinde tüm dijital pazarlama kanallarının yönetimini gerçekleştirdi. 2016 Haziran’da puhutv projesi için Doğuş Grubu’na Pazarlama Müdürü olarak geçiş yaptı. Kısa zamanda tüm Türkiye’ye erişim sağlamış olan puhutv projesinin 360° dijital pazarlama stratejisini yönetti. 2018 yılında dünyanın en çok kazanan mobil uygulamalarını yöneten Güney Koreli mobil uygulama firması olan Hyperconnect’te Senior Marketing Manager olarak çalışmaya başladı. 2020 yılında kurumsal hayata veda ederek orta ve büyük ölçekli şirketlere eğitimler ve dijital pazarlama danışmanlığı vermeye başladı. 2022 yılında bayiler için özelleştirilmiş dijital pazarlama platformu olan Branchsight‘ı kurdu. 7. baskısı yayınlanan "Dijital Pazarlama Temelleri" kitabını yazan Emre Gökşin İTÜ, Boğaziçi ve ODTÜ gibi birçok üniversitede Dijital Pazarlama Eğitimleri verdi. 2018 Yılında Udemy'de yayınladığı 360° Dijital Pazarlama Eğitimine 12.000'den fazla öğrenci katıldı.